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恶意注册短信是违法的，可以通过以下途径举报。
1、前往国家工信部网站进行投诉举报，具体可以搜索并打开“中华人民共和国工业和信息化部电信用户申诉受理中心”，在首页找到并点击“用户申诉”选项，阅读申诉须知后点击“我要申诉”选项，最后填写相关信息即可。
2、拨打相关运营商的客服电话进行投诉举报，如中国移动客服电话为10086，中国联通客服电话为10010等，向运营商说明情况后，提供相关证据和手机号码，运营商将会进行处理。
3、向公安机关举报，由于恶意注册短信涉及到个人信息泄露等问题，公安机关有权对此进行调查和处理，可以通过拨打当地公安机关电话或前往当地公安机关报案。
在举报过程中，建议保存好收到的恶意注册短信以及相关证据，以便向有关部门提供证明，也要注意保护个人信息，避免个人信息被不法分子利用。
仅供参考，如需更专业的解答，可以咨询专业的法律人士以获得更准确的指导。